Al mando del Ministerio de Interior y Justicia, apoyó activamente la lucha contra las FARC. En 2004, fue inhabilitado por la Procuraduría para ejercer cargos públicos
Londoño Hoyos había recibido amenazas, afirmó el mandatario colombiano Juan Manuel Santos al condenar el atentado ocurrido en Bogotá.
Al menos en una ocasión, Londoño Hoyos fue objeto de un intento de atentado contra su vida, que las autoridades atribuyeron a las FARC, por esa razón se movilizaba en un automóvil blindado y tenía custodia.
Como tantos otros funcionarios del Gobierno de Uribe, durante su gestión (2002-2004) había participado activamente de la lucha contra la guerrilla. Cuando dejó el Ministerio del Interior, este abogado, economista y miembro del Partido Conservador mantuvo su actividad pública a través de los medios de comunicación.
Actualmente es director del programa de radio La Hora de la Verdad en la Cadena Súper de Colombia y es como columnista de los diarios El Tiempo y El Colombiano, desde donde mantiene vigentes sus ideas en contra del terrorismo.
En su programa, el ex ministro trata sobre política y economía nacional y ha realizado numerosas críticas a Santos en materia de seguridad y defensa por considerar que flexibilizó las políticas de su antecesor. También atacó duramente al presidente venezolano Hugo Chávez.
Londoño Hoyos, de 67 años, también se desempeña como docente en la Pontifica Universidad Javeriana y ha actuado como jurista litigante en derecho civil, mercantil, financiero, administrativo y penal.
En diciembre de 2004, la Procuraduría General de la Nación lo inhabilitó a ejercer cargos públicos por 15 años tras un proceso en el que se consideró que incurrió en conflicto de intereses y usó abusivamente su autoridad a favor de una empresa italiana.
